MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Methylobacterium extorquens CM4 plasmid pMCHL02

Total Repeats: 97

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011760	TGT	2	6	3	8	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011760	TGA	2	6	32	37	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011760	CG	3	6	70	75	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_011760	CTGCA	2	10	81	90	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5	NC_011760	CAG	2	6	1025	1030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_011760	GC	3	6	1121	1126	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_011760	CGG	2	6	2007	2012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_011760	TTG	2	6	2016	2021	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011760	GCA	2	6	2059	2064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_011760	GAGAG	2	10	3940	3949	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011760	CAT	2	6	3990	3995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_011760	CAT	2	6	4069	4074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_011760	GGC	2	6	4164	4169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_011760	TGG	2	6	4210	4215	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011760	TC	3	6	4633	4638	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_011760	ACCT	2	8	4659	4666	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_011760	CCT	2	6	4703	4708	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_011760	CAG	2	6	4720	4725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_011760	ACG	2	6	4783	4788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_011760	CGC	2	6	4800	4805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_011760	TCG	2	6	4837	4842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_011760	CAGC	2	8	5520	5527	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
23	NC_011760	GC	3	6	5526	5531	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_011760	CCG	2	6	5558	5563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_011760	TCA	2	6	5580	5585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_011760	CAC	2	6	5622	5627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_011760	CCA	2	6	5705	5710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_011760	TCC	2	6	5720	5725	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_011760	CAA	2	6	5750	5755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_011760	GAA	2	6	5757	5762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011760	GGT	2	6	6025	6030	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011760	CGA	2	6	6124	6129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_011760	CAAT	2	8	6172	6179	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_011760	AGC	2	6	6181	6186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_011760	CGC	2	6	6189	6194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_011760	ACG	2	6	6234	6239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_011760	AACGC	2	10	6249	6258	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
38	NC_011760	CCT	2	6	6400	6405	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_011760	GAA	2	6	6418	6423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011760	GCGCT	2	10	6441	6450	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
41	NC_011760	GGC	2	6	6558	6563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_011760	GCA	2	6	6591	6596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_011760	CGAT	2	8	6648	6655	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_011760	GC	3	6	6756	6761	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_011760	C	6	6	6771	6776	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
46	NC_011760	ACC	2	6	6811	6816	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_011760	TG	3	6	7235	7240	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011760	TGA	2	6	7312	7317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011760	TTG	2	6	7328	7333	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011760	GCCC	2	8	9133	9140	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
51	NC_011760	TCCC	2	8	9463	9470	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
52	NC_011760	CCCTGC	2	12	11339	11350	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_011760	CGC	2	6	11365	11370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_011760	AGG	2	6	11394	11399	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011760	C	6	6	12381	12386	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
56	NC_011760	GCC	2	6	12405	12410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_011760	CCCT	2	8	12480	12487	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
58	NC_011760	GGC	2	6	12551	12556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_011760	CTG	2	6	12733	12738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_011760	TCC	2	6	13431	13436	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_011760	GCA	2	6	13471	13476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_011760	CCTCT	2	10	13491	13500	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
63	NC_011760	TGG	2	6	13502	13507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011760	GCCG	2	8	13515	13522	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_011760	CCA	2	6	13539	13544	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_011760	CGG	2	6	13556	13561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_011760	GCC	3	9	13578	13586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_011760	CCG	2	6	14078	14083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_011760	CAAGA	2	10	14182	14191	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
70	NC_011760	CCCG	2	8	15120	15127	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
71	NC_011760	GGC	2	6	15132	15137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_011760	CAT	2	6	15215	15220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_011760	GGCG	2	8	15227	15234	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
74	NC_011760	GC	3	6	15295	15300	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
75	NC_011760	GGGT	2	8	15306	15313	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011760	CCGCTG	2	12	15357	15368	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
77	NC_011760	AGAGG	2	10	15379	15388	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011760	CG	3	6	15400	15405	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_011760	CAT	2	6	15490	15495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_011760	GTC	2	6	15527	15532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_011760	CCG	2	6	15541	15546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_011760	AGC	2	6	15666	15671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_011760	A	7	7	15727	15733	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011760	AT	3	6	15821	15826	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011760	AT	4	8	15840	15847	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011760	GGC	2	6	17334	17339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_011760	ATCG	2	8	17378	17385	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
88	NC_011760	AG	3	6	17430	17435	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011760	ATT	2	6	17889	17894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011760	GGC	2	6	17915	17920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_011760	TC	3	6	17967	17972	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_011760	GTT	2	6	17977	17982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011760	GGTC	2	8	18015	18022	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
94	NC_011760	GC	3	6	18035	18040	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
95	NC_011760	GC	3	6	18056	18061	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
96	NC_011760	GTC	2	6	22358	22363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_011760	GCGG	2	8	22369	22376	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.